Meskipun keduanya beroperasi di atas air, pengeruk dan pengeruk pasir berbeda secara signifikan dalam beberapa aspek. Pertama, dalam hal aplikasi, pengeruk pasir fokus pada pengumpulan pasir dan kerikil dari sungai atau laut dangkal, cocok untuk proyek konstruksi dan dasar jalan; sedangkan pengeruk terutama digunakan untuk mengeruk saluran sungai dan pelabuhan guna memastikan navigasi tanpa hambatan, serta juga cocok untuk pemeliharaan danau dan waduk. Kedua, dalam hal operasi, pengeruk pasir menggunakan pompa hisap untuk mengekstrak pasir dan tanah, yang kemudian dipisahkan dan disaring untuk mendapatkan pasir dan kerikil yang diinginkan; pengeruk menggunakan perangkat penggalian untuk langsung mengeruk sedimen dasar sungai dan memisahkan lumpur dari air. Dalam hal desain struktural, pengeruk pasir besar dan berat, dengan kapasitas penyimpanan pasir yang kuat, tetapi daya penggalian terbatas; pengeruk memiliki struktur kompleks, dilengkapi dengan boom, pemotong, dan perangkat lain, sehingga menghasilkan kemampuan penggalian dan transportasi yang kuat. Akhirnya, dalam hal operasi, mesin pengeruk pasir mengandalkan operasi dan manajemen manual, serta harus menavigasi sesuai dengan distribusi pasir dan kerikil; mesin pengeruk dapat melakukan penggalian titik tetap dan memiliki tingkat otomatisasi yang lebih tinggi.